Предпочтительным является исследование утренней порции мокроты, перед ее сбором необходимо почистить зубы и прополоскать рот кипяченой водой. Мокроту собирают в стерильный широкогорлый контейнер с завинчивающейся крышкой. Доставляют в лабораторию в течение 2 часов.
В стерильный контейнер собирают среднюю порцию свободно выпущенной мочи в количестве 3— 5 мл. Перед взятием материала больной должен совершить тщательный туалет наружных половых органов. Немного помочиться, отбросив первую порцию мочи. Следующую порцию мочи выпустить в стерильный контейнер. Закрыть контейнер и передать в лабораторию в течение 2 часов.
За 1 - 3 дня необходимо исключить прием продуктов, усиливающих процессы брожения в кишечнике (черный хлеб, капуста), а также алкоголь и антибиотики. Пробу испражнений отбирают сразу после дефекации с помощью ложки-шпателя, материал помещают в пустой стерильный контейнер и доставляют в лабораторию в течение 2 часов. Объем забираемого материала должен быть не менее 2 г. Оптимальным является взятие материала: в случае оформленного стула — в объеме грецкого ореха; в случае жидкого стула его слой в посуде должен быть не менее 1,5—2 см.
Перед сцеживанием молока женщина моет руки с мылом и тщательно обрабатывает соски и около сосковую область смоченными 70° спиртом ватными тампонами, каждая железа обрабатывается отдельным тампоном. Молоко из правой и левой молочных желез исследуется отдельно, стерильные контейнеры для сбора молока заранее маркируются «П» и «Л». Первые 5—10 мл молока сцеживаются и выливаются, последующие 3—4 мл сцеживаются в стерильные контейнеры с завинчивающимися крышками. Исследование должно быть начато в течение 3 часов (молоко хранят при 4°С).